Tesina - Laboratorio de Biología de Sistemas Moleculares del IFIBYNE

El laboratorio de Biología de Sistemas Moleculares del IFIBYNE (FCEN-UBA)
busca un estudiante de licenciatura en biología, química o carreras
afines para realizar la tesina de licenciatura (o equivalente) durante el 2011 y
que esté en condiciones de presentarse a beca doctoral CONICET este
año, para comenzar en 2012.


El interés general del laboratorio es entender los mecanismos que llevan
a “decisiones de destino celular” (“cell fate decisions”). Si bien
estudiamos los detalles de los mecanismos moleculares, nos interesa principalmente
explicar a nivel del sistema los comportamientos que causan estas
decisiones. Estos comportamientos resultan comúnmente de la interacción
de un número relativamente grande de componentes, por lo que en general
resulta difícil comprender su funcionamiento. Por eso, en el laboratorio
combinamos experimentación cuantitativa con simulaciones matemáticas, con el
objetivo de derivar reglas generales. Esto es lo que corrientemente se conoce
como enfoque de biología de sistemas. Mayormente utilizamos como modelo a la
levadura *Saccharomyces cerevisiae.*

El estudiante se integrará en un proyecto enfocado en entender las bases
moleculares de un mecanismo de decisión de destino celular, la
expresión génica asimétrica dependiente del factor de transcripción Ace2 en
levaduras. Los mecanismo que resultan en expresión génica asimétrica son
responsables de gran parte de la diversidad celular presente en organismos
multicelulares, y ha sido descriptos en bacterias, levaduras, gusanos,
moscas y mamíferos. En nuestro caso particular, el mecanismo último que
causa la asimetría en la actividad de Ace2 no ha sido dilucidado aún y
es en el laboratorio el tema central de una tesis doctoral avanzada. (ver
referencias para una descripción de la biología del proceso en
cuestión y tener una idea del enfoque del laboratorio).

El estudiante investigará la dinámica de transporte nuclear de dicho
factor y un posible mecanismo nuevo de regulación de la actividad
transcripcional.
Se utilizarán enfoques de microscopía cuantitativa confocal, biología
molecular y modelado matemático.

No es necesario que los postulantes tengan conocimientos previos en
modelado matemático o programación. Sí es indispensable buena disposición para
los enfoques matemáticos y computacionales, y para el trabajo experimental.

Los interesados por favor envíen un CV actualizado al Dr. Alejandro
Colman Lerner (colman-lerner@fbmc.fcen.uba.ar). En el cuerpo del mensaje por
favor incluir una breve explicación de por qué les interesaría incorporarse
al laboratorio.

Referencias:
1. Chernomoretz, A., Bush, A., Yu, R., Gordon, A., and Colman-Lerner,
A. (2008). Using Cell-ID 1.4 with R for microscope-based cytometry. Current
protocols in molecular biology / edited by Frederick M Ausubel et al*
Chapter 14*, Unit 14 18.
2. Colman-Lerner, A., Chin, T.E., and Brent, R. (2001). Yeast Cbk1 and
Mob2 activate daughter-specific genetic programs to induce asymmetric
cell fates. Cell* 107*, 739-750.
3. Colman-Lerner, A., Gordon, A., Serra, E., Chin, T., Resnekov, O.,
Endy, D., Pesce, C.G., and Brent, R. (2005). Regulated cell-to-cell
variation in a cell-fate decision system. Nature* 437*, 699-706.
4. Gordon, A., Colman-Lerner, A., Chin, T.E., Benjamin, K.R., Yu,
R.C. and Brent, R. (2007). Single-cell quantification of molecules and rates
using open-source microscope-based cytometry. Nat Methods* 4*, 175-181.
5. Ventura, A.C., Sepulchre, J.A., and Merajver, S.D. (2008). A hidden
feedback in signaling cascades is revealed. PLoS Comput Biol* 4*, 14.
6. Yu, R.C., Pesce, C.G., Colman-Lerner, A., Lok, L., Pincus, D.,
Serra, E., Holl, M., Benjamin, K., Gordon, A., and Brent, R. (2008). Negative
feedback that improves information transmission in yeast signalling.
Nature* 456*, 755-761.

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Alejandro Colman-Lerner
Investigador Adjunto
IFIByNE-CONICET y
Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular
Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
Universidad de Buenos Aires
Ciudad Universitaria - Pabellon 2 - 2º piso
(C1428EHA) Buenos Aires - Argentina
Tel: 54-11-4-576-3386 /4-576-3368, int 119
FAX: 54-11-4-576-3321